Trabajar para el fortalecimiento y consolidación de áreas protegidas y Unidades de Conservación del Patrimonio Natural como Kaa Iya (3.4 millones de ha.), Tucabaca (240 mil ha.) y la nueva área protegida municipal Paquió (34 mil ha), asegura y prioriza los servicios ambientales, la disponibilidad de agua y el patrimonio natural en la región.
Actualmente se tiene planificado fortalecer el programa de comunicación de la Unidad de Conservación Tucabaca y el Área Protegida Kaa Iya, con la producción y aplicación de un sistema de monitoreo SIG. Para Tucabaca la aplicación de un sistema de evaluación de manejo efectivo, como área protegida subnacional piloto.
La SBDA tiene un convenio con el SERVICIO NACIONAL DE ÁREAS PROTEGIDAS, una importante alianza interinstitucional, para el fortalecimiento a la gestión de las áreas protegidas nacionales.
Se han desarrollado centros de monitoreo como para el área protegida Tucabaca y para el área protegida Kaa Iya